Về cơ cấu mặt hàng, cá tra và ba sa dẫn đầu với việc chiếm lĩnh thị trường EU, Mỹ; tôm đứng thứ hai với thị trường chính là Nhật Bản. Hiện tại, thị trường Nga cũng đang có nhu cầu tiêu thụ khá lớn và đa dạng về mặt thàng cá tra, basa. Theo dự báo, kim ngạch xuất khẩu mặt hàng này trong năm 2009 có thể đạt khoảng 1,3 tỷ USD, vượt dự kiến 1 tỷ USD đề ra từ đầu năm.

Tuy nhiên, theo đánh giá của Bộ Nông nghiệp và Phát triển Nông thôn những tháng gần đây, tác động của suy thoái kinh tế thế giới đã khiến nhiều mặt hàng thủy sản bị giảm giá, khó tiêu thụ.

Bên cạnh đó, một sản phẩm có giá trị là cá ngừ đã bị sụt giảm sản lượng vì lệnh cấm đánh bắt của Trung Quốc, khối lượng cá ngừ xuất khẩu cũng chỉ đạt chưa đầy 18.300 tấn, giảm 17,5% và kim ngạch cũng giảm 23%.

Xu hướng khó khăn trong sản xuất và tiêu thụ sản phẩm thủy sản được dự báo sẽ tiếp tục trong những tháng cuối năm, không chỉ từ phía thị trường xuất khẩu mà cả từ khâu nguyên liệu sản xuất. Bởi vậy, kim ngạch xuất khẩu nhóm hàng này có thể giảm khoảng 15 - 20% so với mức 4,5 tỷ USD của năm ngoái